فروشگاه انتشارات ققنوس در بهمن‌ماه سال ١٣٥٦ آغاز به کار کرد و تاکنون، ققنوس بیش از هزار عنوان کتاب در حوزه‌های گوناگونی چون ادبیات، داستان، تاریخ، فلسفه، روانشناسی و… منتشر کرده است.
توجه ویژه به نشر آثاری متفاوت در حوزه کودک و نوجوان از همان ابتدای فعالیت انتشارات ققنوس باعث تولد «نشر سرود» شد که آثار باکیفیتی برای این گروه سنی چاپ و عرضه می‌کرد، از جمله آثار نسیم خاکسار، قدسی قاضی‌نور، داریوش عبادالهی، جواد مجابی و… نشر سرود، از زیرمجموعه‌های ققنوس، بعدها جای خود را به انتشارات آفرینگان داد.
گرچه کشورِ ما عضو کنوانسیون برن نیست و، به تبع آن، ناشران ایرانی ملزم به رعایت قوانین کپی‌رایت نیستند، انتشارات ققنوس از سال ١٣٨٠ تا به حال کوشیده است، حتی‌الامکان و به طور داوطلبانه، آثار نویسندگان خارجی را با کسب رضایت و مجوز ایشان یا ناشران آثارشان منتشر کند.
انتشارات ققنوس در سال ١٣٨٠، در میانه سومین دهه فعالیتش، ناشر برگزیده وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی شد. این افتخار، به نحوی دیگر، در دوازدهمین و چهاردهمین نمایشگاه بین‌المللی کتاب تهران تکرار و ققنوس به عنوان ناشر برگزیده این دو دوره انتخاب شد.
امیر حسین‌زادگان، در سال ١٣٦٧، مرکز پخش ققنوس را تأسیس کرد تا کتاب‌ها به بهترین شکل ممکن در سراسر کشور توزیع شوند و در اختیار مخاطبان قرار گیرند. این مرکز، علاوه بر توزیع کتاب‌های انتشارات ققنوس و هیلا و آفرینگان، نمایندگی فروش و توزیع انحصاری حدود یکصد ناشر را به عهده دارد و با اکثر کتابفروشان کشور همکاری می‌کند.
علاوه بر پخش، توسعه فعالیت‌های مجموعه ققنوس به تأسیس دو انتشارات دیگر منجر شده است: انتشارات آفرینگان که اختصاصاً آثار کودک و نوجوان را منتشر می‌کند و انتشارات هیلا که در زمینه انتشار آثار ادبی، رمان و داستان کوتاه، فعالیت دارد. مراحل آماده‌سازی کتاب‌های این دو نشر نیز در تحریریه انتشارات ققنوس انجام می‌گیرد.
گروه انتشاراتی ققنوس، به منظور گسترش فعالیت خود و ایجاد فضای مناسبی برای حضور بیشتر علاقمندان به کتاب و امور فرهنگی مجوز موسسه فرهنگی-هنری ققنوس راوی دوران را در سال ۹۶ دریافت کرد و با افتتاح این مجموعه در آبان ماه سال ۹۸ گامی دیگر در جهت همدلی و همبستگی بیشتر اجتماعی برداشت.
